很快我们周身的场景又发生了变化，我们像是来到苍穹宇宙里一样，不过更像是虚拟投影，一颗神级文明的星球，上面爆发了一场大战，导致他们的星球出现了问题，他们身高三米外貌特征和我们人类一样，他们星球核心是由黄金一样的液体运转的，等战争结束后他们的几个首领和平共处，并研究了修补星球计划，他们的星球每3000年进入一次太阳系，他们在太阳系发现了一个适合改造的星球（地球)，他们将宇宙尘埃引入地球，并利用自身基因改造地球，让地球几亿年间经历几代生物更迭，在这期间他们发现宇宙尘埃还携带了能量，生物吸收后就会变得他们不可控，直到最接近他们的生物诞生(人类)，上古时期的人类对比现代人类简直就是巨人，他们一直在奴役着巨人，指导着巨人发生着战争，让地球的生物都按照他们的剧本进行，在遥远的上古纪元，地球还不是今日这般模样。那时的大地被巨型蕨类与奇异兽类覆盖，天空常年浮动着淡金色的尘雾，那些尘雾并非自然生成，而是宇宙尘埃带来的能量，开始产生了他们未曾预料的变化。他们有了情感、有了叛逆、有了“我是谁”的思考。在最初的几个世纪里，巨人仍处于他们的完全控制中，他们在这些如今已湮灭的古地上建立神庙、修筑金属祭坛，执行“天命战争”，在神明安排的剧本中相互厮杀。但变化悄悄发生了。某一日，一位名叫“共工”的巨人，在战斗重伤之际，身体自动激活了被封锁的高维基因链。他在梦中看见了天空深处那颗母星的碎片，看见了神族在实验仓中编辑他们基因的画面。他醒来后，第一句话不是赞颂神明，而是低语道：“我们不是他们的奴仆。”
这一觉醒如烈火燎原，极少数觉醒者相继出现，他们开始秘密传播真实历史，摧毁神族留在地球上的能量锚点，篡改祭坛结构，干扰神谕投射。觉醒者知道，若要真正挣脱命运锁链，就必须摧毁那个横贯天地、连接宇宙母星的终极装置——通天神树·那不是一棵真正的树，而是一座由液态金属与星体骨架交织而成的传送阵，它根植地壳之下，树干贯穿大气层，同时也是他们进行远程投影、能量传送与思想干预的通道。
于是，巨人和他们的战争爆发了。
不是为权力、不是为疆域，而是为夺回被篡改的“存在权”。
数十万觉醒巨人从四极之地汇聚而来，他们以血肉登上神树主干，与他们作战。那些高高在上外星神族不再是信仰中的光辉之主，而是从天而降的冷漠操控者，他们以超音速震荡破碎巨人骨骼，以粒子风暴掀翻地脉，他们以原始之怒回击神技，他们由于吸收了宇宙尘埃带来的能量，召唤星能，在漫长而毁灭性的战斗后，共工率领最后一支军团抵达通天树的能量核心，他们以自我为引爆节点，终于在一声响彻星空的爆鸣中，摧毁了通天神树。
天地震裂，神族的能量信号中断，主星的远程接触永远失联。自那之后，神明不再降临，世界陷入失控，而地球，第一次成为了自己命运的主宰。
但代价沉重。多数觉醒巨人战死，幸存者伤痕累累。由于神族最后的封印。他们封锁基因通道、削弱人类结构，将力量压缩于更小、最终一代代退化为今日的人类。失去了身高、失去了能量、失去了记忆……但他们保留了最重要的东西：潜意识中的反抗意志